近日監察院糾正中科院於採購無人機的標案有諸多問題，認為有違反行政法人法與國家中山科學研究院設置條例等規定，監察委員蔡崇義指出，中科院採購並不適用政府採購法（下稱採購法），有違反公平採購精神，姑且不論監察委員們所糾正中科院違規之內容，為何中科院此一國家單位進行採購，會不適用政府採購法呢？
依照行政法人法第6條第2項規定：「前項採購，除符合政府採購法第四條所定情形，應依該規定辦理外，不適用該法之規定。」，而國家中山科學研究院設置條例第2條規定：「本院為行政法人；監督機關為國防部。」，也就是將中科院定位為「行政法人」，原則上排除適用政府採購法，而適用中科院自己制定的採購規定，除非是有該設置條例第4條所稱：「公務機關依政府採購法第一百零五條第一項第三款規定辦理採購者，本院視為公務機關，國防部視為其上級機關。」，也就是「緊急採購」的情況，像是：「一、國家遇有戰爭、天然災害、癘疫或財政經濟上有重大變故，需緊急處置之採購事項。二、人民之生命、身體、健康、財產遭遇緊急危難，需緊急處置之採購事項。三、公務機關間財物或勞務之取得，經雙方直屬上級機關核准者。四、依條約或協定向國際組織、外國政府或其授權機構辦理之採購，其招標、決標另有特別規定者。」
而排除適用採購法有何好處呢？就是比照民間大企業處理，像是連鎖超商、連鎖電信業者對於直營店的裝潢，就會適用統一的採購內規處理，許多政府機關公司化、企業化，甚至民營化，都是為了提升效率、速度，倒不是說採購法不能做到這一點，然採購法諸多防弊機制，某程度上確實和民間企業不太相同，行政法人當初立法設置的目的，某程度上就會為了和民間企業看齊，所以才會特別規定原則上可以不適用採購法。
而且不適用採購法後，採購法相關的停權、沒收押標金、刑責，基於處罰法定主義與罪刑法定主義，相關採購人員也可以免其責任，因為他們不是依照採購法辦理採購案件，這也是監察院這次質疑的重點，委員們質疑的出發點就是有必要為了效率，犧牲防弊嗎？公平採購的精神真的不重要嗎？
為了回應監察院的糾正，又或是為了向監察院交代，相關中科院採購內規或許要做個回應，不然即使中科院是行政法人，和一般機關有所不同，也不代表就可以獨立於行政院之外，無視監察院基於憲法所為的監督。